DNA亲子鉴定原理，除了同卵双胞胎外，每一个人身上双股螺旋DNA所带的碱基对顺序(DNA序列）都是独一无二的，亦即，人体内30亿对DNA碱基序列具有如同指纹般人各不同的区别效力。虽然如此，但是当我们欲区分两个样本（检体）是否为同一人所有时，在实际上并非将这30亿个碱基对完全译码出来，而是藉由DNA本身所具有的多型现象，选出极少部分的特定多型区域，分析该区域的多型DNA片段，再透过统计的方式，建立DNA多型在人口中出现之几率，然后连结数种各自独立无连锁关系的DNA多型系统，组成一个足以在特定族群间达到区辨所有人口的DNA多型出现频率数据库（基因出现频率数据库)